Dans l’atrium et le vestibule de la Bibliothèque Lancisiana se déploie la grande bibliothèque en bois du XVIIIe siècle, surmontée de cartouches portant en lettres d’or les noms des différentes disciplines. Depuis sa fondation, la bibliothèque conserve ses précieux codex dans ces rayonnages. Au centre de la salle, de part et d’autre du grand arc en plein cintre, veillent les bustes des papes dont Giovanni Maria Lancisi fut l’archiatre pontifical : Clément XI (Gian Francesco Albani) et Innocent XI (Benedetto Odescalchi). Réalisés en marbre par des artistes de l’école romaine de la première moitié du XVIIIe siècle, ils reflètent les canons esthétiques de l’école berninienne. La présence de mortiers et de céramiques pharmaceutiques (XVIe-XIXe siècles) témoigne avant tout du lien étroit entre l’étude et la pratique pharmaceutique.