A través del portal que da acceso a la logia—coronado en el exterior con el escudo del papa Clemente XIV Ganganelli y en el interior con el de Teseo Aldrovandi—se entra en un gran salón completamente decorado con frescos. En las cuatro paredes, imponentes marcos ilusionistas, diseñados para parecer ricos tapices drapeados, enmarcan escenas a tamaño natural que narran la historia y las actividades del hospital. En el centro del alto techo artesonado de madera, destaca un escudo bipartito con las insignias heráldicas de Teseo Aldrovandi, acompañado de la cruz de doble brazo. En la franja superior de las paredes, los escudos papales se alternan con paisajes imaginarios de campos y marinas, acompañados de cartelas que explican su significado alegórico. Estos frescos se atribuyen al círculo de Paul Brill, Cesare Arbasia y Ercole Perillo.

El gran fresco de la pared norte narra la historia de la fundación del Hospital Inocenciano a finales del siglo XII, dedicado a Santa María in Sassia. Su origen se encuentra en la leyenda de la “pesca macabra”, un sueño de Inocencio III en el que unos pescadores rescatan del Tíber los cadáveres de recién nacidos, arrojados al río por sus propias madres, y los presentan al papa. En realidad, durante su pontificado, comenzó la refundación del hospital como un refugio para niños abandonados, pobres y mujeres solas, además de proporcionar atención médica gratuita a enfermos de todas las clases sociales. Este principio excluía la idea de la enfermedad como castigo divino. Sobre el gran fresco, dos figuras femeninas—alegorías de la Misericordia y la Pietas—se sitúan junto a las armas heráldicas de Inocencio III: un águila ajedrezada en negro y oro, que define la misión del pontífice.

En la pared sur, el fresco representa la siguiente fase de construcción del nuevo hospital, promovida por Sixto IV della Rovere dentro del amplio proceso de renovación de Roma y del área vaticana, iniciado a finales del siglo XV. En la escena aparece el papa montado en la chinea, un caballo blanco reservado a monarcas y personajes ilustres, acompañado por el cardenal Bessarion y la guardia papal. Sixto IV conversa con Baccio Pontelli, célebre arquitecto presente en otras obras sistinas, quien le muestra el proyecto de las nuevas salas del hospital, aún en construcción en el fondo de la escena.

En la pared este domina la escena el escudo papal de Gregorio XIII Boncompagni, que muestra un dragón coronado por la tierra y las llaves cruzadas, flanqueado por dos figuras femeninas—alegorías de la Vigilancia y la Custodia—que introducen el gran fresco inferior, donde se representa la concesión del título de Comendador a Teseo Aldrovandi por parte del pontífice. El símbolo de esta distinción es un paño negro con una doble cruz blanca. A la izquierda, aparecen dos personajes portando sellos, junto a una figura con armadura y casco con plumas, que probablemente alude a la ciudad de Roma. En la esquina inferior derecha, la leyenda cuenta que los autores de la pintura, los hermanos Zucchi, se retrataron de espaldas vestidos como soldados. También dejaron otros indicios de su presencia ocultos en los festones que decoran las esquinas de la sala, donde, entre un denso follaje, se pueden distinguir zucche (calabazas)—un guiño a su apellido—junto con otros productos exóticos del Nuevo Mundo, muy codiciados en la época.

En la pared oeste, bajo el monumental escudo de Sixto IV della Rovere—fundador del hospital—flanqueado por las alegorías de la Perseverancia y la Providencia, el fresco representa con gran detalle las principales actividades realizadas dentro del hospital. La escena muestra la labor de todos los que participaban en esta gran obra de caridad, atención y acogida.

El elemento central de la escena es la práctica de la lactancia nodriza. El hospital se encargaba de contratar y pagar, con una modesta remuneración, a nodrizas procedentes principalmente del campo cercano, para que amamantaran a los niños y velaran por su salud e higiene. A medida que crecían, su educación quedaba en manos de las monjas hasta la edad adulta. Los niños eran formados en un oficio, mientras que a las niñas, siempre que era posible, se les proporcionaba una dote y un matrimonio concertado. En caso contrario, continuaban alojadas en el hospital, desempeñando funciones como sirvientas, enfermeras o monjas.

Otra actividad que dio prestigio al hospital fue la creación de una prestigiosa escuela de música en su interior, basada en una antigua tradición ya mencionada en el Liber Regulae Sancti Spiritus. Músicos de gran renombre, como Pasquini, Frescobaldi y Zoilo, impartieron clases de canto, clavecín, órgano y flauta, guiando a los jóvenes alumnos hacia carreras musicales. Además, la música se consideraba un valioso apoyo en la atención a los pacientes. Un órgano, situado entre las dos salas del hospital, proporcionaba alivio a los enfermos durante sus largas estancias, y se creía que el sonido de la flauta durante la lactancia favorecía el flujo de la leche.

En el fondo de la gran escena coral, se vislumbra una vista de las salas del hospital, que muestra la atención y asistencia brindada a los pacientes. Las salas estaban equipadas con camas con dosel numeradas, provistas de mantas y ropa de cama, y contaban con la presencia constante de personal de enfermería, bajo la supervisión de los miembros de la cofradía.